PyBerny

Molecular/crystal structure optimizer

https://secure.travis-ci.org/jhrmnn/pyberny.svg?branch=master

https://codecov.io/github/jhrmnn/pyberny/coverage.svg?branch=master

Navigation

  • Getting started
  • Algorithm
  • API

Related Topics

  • Documentation overview

Quick search

Index

A | B | C | D | F | G | I | L | M | O | R | S | T | W

A

  • angstrom (in module berny.coords)

B

  • Berny (class in berny)
  • berny (module)
  • berny.geomlib (module)
  • berny.solvers (module)
  • bondmatrix() (berny.Geometry method)

C

  • cms() (berny.Geometry property)
  • converged() (berny.Berny property)
  • copy() (berny.Geometry method)

D

  • defaults (in module berny.berny)
  • dist() (berny.Geometry method)
  • dist_diff() (berny.Geometry method)
  • dump() (berny.Geometry method)
  • dumps() (berny.Geometry method)

F

  • formula() (berny.Geometry property)
  • from_atoms() (berny.Geometry class method)

G

  • Geometry (class in berny)

I

  • inertia() (berny.Geometry property)

L

  • load() (in module berny.geomlib)
  • loads() (in module berny.geomlib)

M

  • masses() (berny.Geometry property)
  • MopacSolver() (in module berny.solvers)

O

  • optimize() (in module berny)

R

  • readfile() (in module berny.geomlib)
  • rho() (berny.Geometry method)

S

  • super_circum() (berny.Geometry method)
  • supercell() (berny.Geometry method)

T

  • trust() (berny.Berny property)

W

  • write() (berny.Geometry method)
©2016-2021, Jan Hermann. | Powered by Sphinx 2.4.4 & Alabaster 0.7.12